建設公司為營利事業，2.0下理應依持有期間課不同稅率，但政府為鼓勵生產性活動，若建屋出售後第一次移轉，一律課20%，而買賣成屋則依房地合一稅2.0的規定。
因建設公司多為建屋出售，故此文僅談建屋出售之課稅規定。
先來考古一下，早年建設公司合建態樣多半為合建分售居多，原因在於個人土地交易所得免所得稅，致產生利用人頭地主採合建分售方式興建房屋出售，意圖規避稅負之情況。而營建業複雜情況在於，除了有人頭地主，還有隱名股東之情況。
而國稅局應對方式則採：
- 對合建分售地主而言，若被稅捐稽關認定為營利事業，則將地主視同營業人，視為營利所得，併入個人綜合所得稅中核課。而營利所得之計算，大多採同業利潤標準淨利率10%(6700-12不動產投資開發)來核課，也就是營利所得=土地收入*10%*綜所稅稅率40%=4%
- 對隱名地主而言，納稅義務人是以隱名的方式，與他人合夥購買土地，且未將土地產權 過戶在自己名下，而是登記在他人名下，因提供資金的隱名出資者對土地沒有所有權，土地不符合所得稅法第4條第1項第16款免稅所得之規定。也就是視為其他所得非營利所得，兩者差異在於質所得無淨利率10%可以適用，若無法舉證成本費用情況下，全部土地款併入個人綜合所得稅內課徵，個人最高稅率為40%。
也因為稅捐稽關查稅查得緊，建設公司為避免稅務爭訟，後多採自地自建居多。
而新制房地合一稅2.0下，建設公司若為自地自建情況下，會有(1)土地舊制、房屋新制及(2)土地、房屋皆新制之情況，課稅方式如下表：
- 小結：擁有舊制土地稅負最省，有遠見的建設公司，早年買大量土地囤下來到現在的話，除了賺資本利得，還可以省稅，真的是一舉數得，獲利豐厚。
而新制房地合一稅2.0下，建設公司若為合建分售、合建分屋之情況下，建設公司只有房屋新制可適用，也就是房屋所得就依照營利所得稅課稅規定(申報方式維持合併計算稅額及報繳)就行了。
看來建設公司在房地合一稅2.0施行下，影響並不大。但許多客戶會問以下問題。
- 未來購地規畫(新制)，到底以個人名義(合建分售)、還是以公司名義(自地自建)購地好?
- 若規畫為自地自建，土地及房屋所得仍併計營利事業所得額課稅(申報方式維持合併計算稅額及報繳)，稅率為 20%。也就是說，所有成本費用，只要與營業相關，均可列入減除項目。
- 若規畫合建分售，地主雖土地交易所得仍採20%計，但費用抵扣項目則僅有以下：
(1)購入房屋、土地達可供使用狀態前支付之必要費用（如契稅、印花稅、代書費、規費、公證費、仲介費等）， 及於房屋、土地所有權移轉登記完成前，向金融機構借款之利息。(要點十三)
(2)個人交易房屋、土地所支付之必要費用，如仲介費、廣告 費、清潔費、搬運費、換約費等，得列為費用減除。但依土地稅法規定繳納之土地增值稅，除依第十六點規定計算之稅額外，不得列為費用減除。取得房屋、土地所有權後，繳納之房屋稅、地價稅、管理費、清潔費、金融機構借款利息等，屬使用期間之相對代 價，不得列為費用減除。(要點十五)
- 小結：雖都是20%，但費用抵扣則以自地自建較為有利。